药学院科研条件较完善，拥有实验教学、科研用房面积达2340M2，配置有三重四极杆液质联用仪、离子阱质谱仪、凝胶成像、气相色谱仪、PowerLab数据采集分析系统等价值近两千万元的现代化教学科研仪器设备。拥有成熟的药物合成、结构修饰、天然药物提取、结构鉴定、活性筛选等平台，同时拥有体内、外抗活性检测，药效学（包括毒理学）、药动学研究等临前研究和抗肿瘤药物筛选成熟技术和相匹配的资源设置。药物研发所涉及到的生物化学、分子生物学、细胞生物学、有机化学、分析化学、物理化学、生物分离技术以及生理学、药理学、药物化学、药物分析学、药剂学、生物信息学等多学科力量完全具备。

过去五年内共获批国家自然科学基金项目8项，安徽省自然科学基金项目3项，教育厅自然科学研究重点项目3项，省厅级其他研究项目14项，承担各级各类科研课题共160余项，共发表科研论文300余篇，其中SCI论文近百篇；主、参编教材、专著30余部。承担的部分科研项目如下：

                                                                 近五年药学院承担的主要科研项目