药物化学教研室成立于2003年4月，目前有教师8名，其中教授1名（毕业于四川抗生素研究所），高级工程师1名（硕士，毕业于南京大学），副教授3名（博士2名，分别毕业于韩国忠南国立大学、安徽医科大学；硕士1名，毕业于日本国立岐阜大学）、讲师2名（博士2名，分别毕业于延边大学、中国海洋大学）、助教1名（硕士、毕业于中国海洋大学），形成了一支年龄层次、知识结构较为合理的教师队伍。

药物化学教研室承担药学、药物分析及制药工程专业《药物化学》理论和实验课的教学，《天然药物化学》理论和实验课的教学，《波谱解析》理论课教学。教研方面，药化教研室积极应用现代教育技术平台。以教学设计理论为指导，编制了全课程的教学课件，探索适合现代医学教育发展的教学模式，注意培养学生提出问题、分析问题、解决问题的能力及创新能力，形成独特的教学风格，打破“以教师、教材、课堂为中心”的传统教学观念，积极实施“以学生为主体，以教师为主导，以网络为场所”的现代教学模式，增加教学的灵活性、互动性、针对性和开放性，是教学质量稳定提高。承担省级质量工程项目2项；承担国家级大学生创新训练项目6项、省级大学生创新训练项目3项；累计获全国高校药学类青年教师教学竞赛奖项4项；参编教材1部：中国医药科技出版社《药物化学》。

科研方面，药物化学教研室积极开展科研活动，目前已形成靶向抗肿瘤药物的筛选及机制研究、药物合成、中药有效成分研究、微生物次级代谢产物研究等科研方向，承担国家级科研项目3项、省级科研项目10项、蚌埠市科技计划项目1项及校级科研项目5项。此外，以第一作者或通讯作者发表了SCI论文30余篇，授权国家发明专利4项。

。